Thập niên 2000 đánh dấu một giai đoạn đặc biệt của bóng đá Pháp cấp câu lạc bộ. Sau thành công rực rỡ của đội tuyển quốc gia tại World Cup 1998 và Euro 2000, sự chú ý bắt đầu đổ dồn về giải vô địch quốc gia Ligue 1 và những đại diện ưu tú của nó trên đấu trường châu Âu. Một số câu lạc bộ đã thực sự bứt phá, không chỉ thống trị giải quốc nội mà còn tạo dựng được danh tiếng và vị thế đáng nể trên bản đồ bóng đá thế giới.
Nổi bật nhất trong giai đoạn này chắc chắn là Olympique Lyonnais (Lyon). Dưới sự dẫn dắt của chủ tịch Jean-Michel Aulas và các huấn luyện viên tài năng như Paul Le Guen, Gérard Houllier và Alain Perrin, Lyon đã thiết lập một kỷ lục vô tiền khoáng hậu với 7 chức vô địch Ligue 1 liên tiếp từ năm 2002 đến 2008. Sự thống trị tuyệt đối này không chỉ dựa vào sức mạnh tài chính mà còn nhờ chính sách đào tạo trẻ hiệu quả và khả năng chiêu mộ những ngôi sao chất lượng. Những cái tên như Juninho Pernambucano với kỹ năng sút phạt siêu hạng, Michael Essien, Florent Malouda, Mahamadou Diarra, Éric Abidal, và sau này là Karim Benzema đã trở thành biểu tượng cho giai đoạn hoàng kim của CLB. Tại Champions League, dù chưa thể chạm tới đỉnh cao cuối cùng, Lyon luôn là một đối thủ đáng gờm, thường xuyên lọt vào vòng đấu loại trực tiếp và tạo ra những màn trình diễn ấn tượng, góp phần nâng cao vị thế của bóng đá Pháp.
Bên cạnh sự thống trị của Lyon, AS Monaco cũng đã có một mùa giải thần kỳ, ghi dấu ấn đậm nét trên đấu trường danh giá nhất châu Âu. Mùa giải 2003-2004, dưới sự chỉ đạo của huấn luyện viên Didier Deschamps, đội bóng Công quốc đã viết nên câu chuyện cổ tích tại Champions League. Với lối chơi tấn công rực lửa và dàn cầu thủ đang ở độ chín như Ludovic Giuly, Jérôme Rothen, Patrice Evra, cùng sự bùng nổ của tiền đạo Fernando Morientes (mượn từ Real Madrid), Monaco đã lần lượt vượt qua những đối thủ sừng sỏ như Real Madrid và Chelsea để tiến vào trận chung kết. Dù thất bại trước Porto của José Mourinho, hành trình phi thường đó đã giúp Monaco và bóng đá Pháp nói chung nhận được sự ngưỡng mộ và công nhận rộng rãi trên toàn thế giới.
Khoảnh khắc lịch sử của AS Monaco tại trận chung kết Champions League 2004, dấu ấn không thể phai của bóng đá Pháp
Một cái tên khác không thể không nhắc đến là Olympique de Marseille (OM). Dù không có được sự ổn định và thành công vang dội như Lyon ở giải quốc nội, Marseille vẫn luôn là một thế lực đáng gờm và duy trì được sự hiện diện mạnh mẽ ở đấu trường châu Âu. Điểm nhấn đáng chú ý là việc lọt vào trận chung kết UEFA Cup năm 2004 (tiền thân của Europa League). Mặc dù để thua Valencia, nhưng màn trình diễn của OM, đặc biệt là sự tỏa sáng của siêu sao Didier Drogba trong mùa giải duy nhất anh khoác áo CLB, đã để lại ấn tượng sâu sắc. Marseille luôn giữ vai trò là một trong những câu lạc bộ giàu truyền thống và có lượng cổ động viên hùng hậu nhất nước Pháp, góp phần duy trì sức hút cho Ligue 1.
Didier Drogba trong màu áo Olympique de Marseille tại UEFA Cup 2004, biểu tượng sức mạnh của câu lạc bộ Pháp thời điểm đó
Ngoài ra, các câu lạc bộ khác như Girondins de Bordeaux với chức vô địch Ligue 1 năm 2009 và những màn trình diễn khá tốt tại châu Âu dưới thời Laurent Blanc, hay Paris Saint-Germain dù chưa thực sự bùng nổ như giai đoạn sau này nhưng vẫn là một cái tên đáng chú ý, cũng góp phần tạo nên bức tranh đa dạng và ngày càng cạnh tranh của bóng đá Pháp trong thập niên 2000.
Nhìn chung, thập niên 2000 là giai đoạn bản lề quan trọng, chứng kiến sự vươn mình mạnh mẽ của các câu lạc bộ Pháp trên đấu trường quốc tế. Sự thống trị của Lyon, câu chuyện cổ tích của Monaco, và sự hiện diện của Marseille đã nâng tầm đáng kể danh tiếng của Ligue 1, khẳng định vị thế của bóng đá Pháp không chỉ ở cấp độ đội tuyển quốc gia mà còn ở cấp câu lạc bộ, tạo tiền đề cho những bước phát triển tiếp theo.
